Detalhe da pesquisa
1.
Rhometa: Population recombination rate estimation from metagenomic read datasets.
PLoS Genet;
19(3): e1010683, 2023 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-36972309
2.
qc3C: Reference-free quality control for Hi-C sequencing data.
PLoS Comput Biol;
17(10): e1008839, 2021 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-34634030
3.
Critical Assessment of Metagenome Interpretation-a benchmark of metagenomics software.
Nat Methods;
14(11): 1063-1071, 2017 Nov.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-28967888
4.
Identification of a novel lineage of plasmids within phylogenetically diverse subclades of IncHI2-ST1 plasmids.
Plasmid;
102: 56-61, 2019 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-30885788
5.
High level of intergenera gene exchange shapes the evolution of haloarchaea in an isolated Antarctic lake.
Proc Natl Acad Sci U S A;
110(42): 16939-44, 2013 Oct 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-24082106
6.
Virophage control of antarctic algal host-virus dynamics.
Proc Natl Acad Sci U S A;
108(15): 6163-8, 2011 Apr 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-21444812
7.
Biogeographic partitioning of Southern Ocean microorganisms revealed by metagenomics.
Environ Microbiol;
15(5): 1318-33, 2013 May.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-23199136
8.
Global biogeography of SAR11 marine bacteria.
Mol Syst Biol;
8: 595, 2012 Jul 17.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-22806143
9.
Simple high-throughput annotation pipeline (SHAP).
Bioinformatics;
27(17): 2431-2, 2011 Sep 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-21775307
10.
The genomic basis of trophic strategy in marine bacteria.
Proc Natl Acad Sci U S A;
106(37): 15527-33, 2009 Sep 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-19805210
11.
Phylogenetic diversity analysis of shotgun metagenomic reads describes gut microbiome development and treatment effects in the post-weaned pig.
PLoS One;
17(6): e0270372, 2022.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-35749534
12.
Post-weaning shifts in microbiome composition and metabolism revealed by over 25â000 pig gut metagenome-assembled genomes.
Microb Genom;
7(8)2021 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-34370660
13.
A large-scale metagenomic survey dataset of the post-weaning piglet gut lumen.
Gigascience;
10(6)2021 06 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-34080630
14.
Metagenomic Hi-C of a Healthy Human Fecal Microbiome Transplant Donor.
Microbiol Resour Announc;
9(6)2020 Feb 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-32029559
15.
bin3C: exploiting Hi-C sequencing data to accurately resolve metagenome-assembled genomes.
Genome Biol;
20(1): 46, 2019 02 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-30808380
16.
Australian porcine clonal complex 10 (CC10) Escherichia coli belong to multiple sublineages of a highly diverse global CC10 phylogeny.
Microb Genom;
5(3)2019 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-30303480
17.
High contiguity genome sequence of a multidrug-resistant hospital isolate of Enterobacter hormaechei.
Gut Pathog;
11: 3, 2019.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-30805030
18.
CAMISIM: simulating metagenomes and microbial communities.
Microbiome;
7(1): 17, 2019 02 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-30736849
19.
Sim3C: simulation of Hi-C and Meta3C proximity ligation sequencing technologies.
Gigascience;
7(2)2018 02 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-29149264
20.
Genomic variation and biogeography of Antarctic haloarchaea.
Microbiome;
6(1): 113, 2018 06 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-29925429